يحدث التهاب فم المعدة في طبقاتها مسبباً تلف غشائها المبطن، من أسبابه: العدوى البكتيرية الحلزونية، تناول مسكنات الألم بكثرة.

قد يتحول الالتهاب إلى قرحة ونزيف في المعدة وقد يؤدي إلى الإصابة بسرطان المعدة إذا كانت البطانة رقيقة.